ELM主要是用来开发并分享对景观镶嵌体生态系统中生物、化学和水文相互作用的更好理解。在生态学领域，模型可以帮助组织或综合我们对系统生态的认识。这样的理解可以应用于评估未来变更的模拟场景的相对利益。
多流向汇流算法模型
HydroGeoSphere 模型是由water-loo大学、Laval大学及Hydrogeologic公司联合研制开发，能够对地下水与地表水的水流及其溶质运移过程进行三维全耦合模拟的模型。该模型对地下水与地表水有两种耦合方式：普通节点方式是假设地表与地下水体之间保持水头的瞬间一致性，在模型的耦合过程中不对地表与地下水体之间的水量交换进行计算；双重节点方式没有假设两个系统间的水头连续性，而是通过达西流关系来描述地表与地下水体之间的水流交换。
连续多流向汇流算法模型
EXAMS是一种交互式软件应用，用于制定水生生态系统模型，并迅速评估包括杀虫剂、工业材料和垃圾处理场在内的合成有机化学物质的过程、运输和染毒浓度。EXAMS包含一个集成的数据库管理系统（DBMS），专门用于存储和管理软件所需的项目数据库。用户交互是由一个功能齐全的命令行界面（CLI）、运用灵活的帮助菜单、在线数据词典和CLI用户指南提供的，并绘制了用于检查输出数据的能力。
PAMOLARE II是一个以潜水湖泊为中心的SDM模型，用于湖泊富营养化管理。它可以适应湿地条件。PAMOLARE II还考虑了物种竞争（水生植物和浮游植物）以及大型水生植物与大型植物间的相互作用。
通用陆面模型是由一些对土地模型感兴趣的科学家们合作开发的以提供给公众使用和进一步开发。主要模型特征包括足够的不均匀间隔层以充分代表土壤温度和土壤湿度，以及雪过程的多层参数化；在雪壤系统中对液态水和冰水的质量进行明确的处理;TopMeod概念下的径流参数化；一种冠层光合作用电导模型，它描述了二氧化碳和水蒸气在植物中同时转移的过程;并对能量和水平衡的次网格分数进行平铺处理。CLM在离线模式下进行了广泛的评估，并与NCAR社区气候模型（CCM3）进行了耦合。
