ELM主要是用来开发并分享对景观镶嵌体生态系统中生物、化学和水文相互作用的更好理解。在生态学领域，模型可以帮助组织或综合我们对系统生态的认识。这样的理解可以应用于评估未来变更的模拟场景的相对利益。
RETC是土壤水分特征曲线拟合的软件。土壤水分特征曲线拟合的软件，和 vanFit 相似 ，但 vanFit 为中文软件，配合压力膜仪，操作简便。 RETC 为英文程序，依照最小二乘法回归原理编写的软件。因涉及公式参数操作，虽功能较全，而易用性稍差。RETC 软件由美国盐土室的 Van Genuchten等（1999）开发，可用于分析非饱和土壤水分和水力传导特性。Simunek 和van Genuchten 等编制RETC 软件RETC软件由 USSL美国盐改中心开发，可用来分析非饱和土壤水分和水力传导特性，它可以很方便的实现土壤转换函数功能，即根据土壤的颗粒级配中砂粒 、粉粒、 粘粒的百分含量以及土壤容重等土壤物理性质数据，可直接输出 Van － Genuchten模型中的4个参数， 由于饱和含水率s已由实验得到。
CAEDYM是一种可独立运行的水生态模型，或与水动力模型的 DYRESM或ELCOM相结合。CAEDYM是由一些列数学方程式组成，这些方程式代表了影响水质的主要生物地球化学过程。CAEDYM模型可方便地同一些水动力学模型进行结合，如一维动态水库模型(DYRESM)和河口、湖泊及海湾模型(ELCOM)。DYRESM-CAEDYM耦合模型在新西兰北部Rotorua湖泊对湖泊3年的水质变化状况进行了成功的模拟；另外强降雨条件下三维水动力学模型和生态模型(ELCOM-CAEDYM)在天鹅河口准确模拟了河口地区不平常的水力条件以及藻类暴发的数量和时间。
AQUATOX 是一个水生态系统模型，主要用来预测不同污染物，如营养物和有机物的转化及其对生态系统的影响。它可以同时计算模拟时段内每天发生的重要化学或生物学过程，模拟生物量、能量及化学物质在生态系统中的转移；因此，他能够建立起水质、生物响应、水生物利用之间的关系链。
生态动力学模拟（EDYS）模型是一个基于机械的通用的生态系统模拟模型。它模拟了自然和人为干涉在水文学、土壤、植物、动物和流域部分的变化。它是一个动态模型，模拟每小时（针对水生）或日常的变化，从几个月到几个世纪。EDYS已经被联邦和州机构用于各种各样的生态评估， 应用在12个州和澳大利亚以及印度尼西亚等35个地点的公司。
多重元素限制（MBL MEL）模型是一个基于过程的生态系统模型，描述了植物和土壤的动态情节尺度，它是植物营养的一种定量的合成方法。资源优化假说预测了植物应该如何分配它们的内部资产（生物量、蛋白质、碳水化合物……）从环境中获取资源（二氧化碳、NH4、NO3、水、光…）。在资源集中不发生变化的环境中，内部资产的最佳分配是环境中的所有资源都同样限制生产的情况。否则，将会有太多的资产用于获得非限制性资源，而将这些资产重新分配给限制资源将会增加生产。随着时间的推移，资源的可用性和新陈代谢需求的变化使这幅图景变得复杂，但总体概念仍然适用：植物应该不断调整其内部资产的分布，以达到从环境中获得更均衡的资源吸收率。