EcoHAT系统以生态水文过程机理研究为基础，从基本的水循环过程入手，在水循环过程中加入营养物质迁移转化过程，综合考虑陆水生态系统中植被/生物生长与水循环要素、营养物质的相互影响。EcoHAT系统的模型构建在综合国内外具有物理化学机制的生态水文过程模型优点基础上，自主创新与国际前沿，经过对模型调整，采用适合中国自然条件的参数，建立本地化的数据库。EcoHAT系统通过区域空间网格参数的输入，实现基于象元的模型运算，因此EcoHAT系统是一个完全分布式的生态水文过程综合模拟的新系统。EcoHAT系统包括水分循环、营养元素循环、植物生长及水生物环境响应四大组成部分，其中水分循环是系统的核心，并贯穿其它三部分的始终。EcoHAT系统中水分循环模拟包括降雨入渗、地表径流、蒸散发、根系吸水和土壤水分五个过程；营养元素循环主要包括土壤中硝化反应、反硝化反应和氨挥发过程模拟，土壤中盐基阳离子循环模拟，以及伴随土壤侵蚀过程产生的吸附态磷元素定量的模拟等；植物生长包括植被生态用水模拟、植被NPP(净第一性生产力)模拟、生产力分配过程模拟和植被营养元素吸收模拟。